Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tgfb1i1Q62219 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tgfb1i1Q62219 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tgfb1i1Q62219 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tgfb1i1Q62219 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tgfb1i1Q62219 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.8 ms