Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Gli3Q61602 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Gli3Q61602 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Gli3Q61602 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Gli3Q61602 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Gli3Q61602 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Gli3Q61602 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Gli3Q61602 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Gli3Q61602 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Gli3Q61602 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Gli3Q61602 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Gli3Q61602 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Gli3Q61602 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Gli3Q61602 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC31,61■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Gli3Q61602 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC31,57■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC31,57■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,57■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC31,56■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC31,56■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31,53■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC31,52■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC31,51■■■□□ 2,64
Gli3Q61602 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC31,51■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC31,5■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC31,48■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31,47■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC31,47■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Gli3Q61602 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC31,44■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC31,42■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC31,42■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC31,42■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC31,42■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC31,41■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC31,4■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC31,39■■■□□ 2,62
Gli3Q61602 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC31,39■■■□□ 2,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,4 ms