Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccne1Q61457 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccne1Q61457 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccne1Q61457 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccne1Q61457 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccne1Q61457 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccne1Q61457 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccne1Q61457 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccne1Q61457 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccne1Q61457 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccne1Q61457 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccne1Q61457 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccne1Q61457 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccne1Q61457 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ccne1Q61457 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccne1Q61457 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccne1Q61457 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccne1Q61457 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccne1Q61457 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms