Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Foxd1Q61345 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Foxd1Q61345 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Foxd1Q61345 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Foxd1Q61345 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Foxd1Q61345 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms