Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ctnna2Q61301 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnna2Q61301 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms