Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsg101Q61187 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tsg101Q61187 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tsg101Q61187 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms