Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JrkQ60976 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JrkQ60976 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JrkQ60976 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JrkQ60976 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
JrkQ60976 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms