Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcf4Q60722 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcf4Q60722 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcf4Q60722 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcf4Q60722 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcf4Q60722 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcf4Q60722 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcf4Q60722 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcf4Q60722 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcf4Q60722 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcf4Q60722 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcf4Q60722 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcf4Q60722 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcf4Q60722 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcf4Q60722 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcf4Q60722 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcf4Q60722 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcf4Q60722 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcf4Q60722 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms