Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uimc1Q5U5Q9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Uimc1Q5U5Q9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uimc1Q5U5Q9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms