Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NotoQ5TIS6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NotoQ5TIS6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NotoQ5TIS6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms