Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Znrf3Q5SSZ7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znrf3Q5SSZ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znrf3Q5SSZ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Znrf3Q5SSZ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znrf3Q5SSZ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znrf3Q5SSZ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znrf3Q5SSZ7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Znrf3Q5SSZ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Znrf3Q5SSZ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms