Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930512M02RikQ5SQK8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930512M02RikQ5SQK8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930512M02RikQ5SQK8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms