Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps54Q5SPW0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps54Q5SPW0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps54Q5SPW0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps54Q5SPW0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vps54Q5SPW0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps54Q5SPW0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps54Q5SPW0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps54Q5SPW0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms