Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brsk1Q5RJI5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brsk1Q5RJI5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brsk1Q5RJI5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brsk1Q5RJI5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms