Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nsrp1Q5NCR9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nsrp1Q5NCR9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nsrp1Q5NCR9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nsrp1Q5NCR9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms