Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5431Q5NCB3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm5431Q5NCB3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5431Q5NCB3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5431Q5NCB3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms