Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttf2Q5NC05 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttf2Q5NC05 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttf2Q5NC05 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttf2Q5NC05 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms