Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grhl3Q5FWH3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grhl3Q5FWH3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grhl3Q5FWH3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Grhl3Q5FWH3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grhl3Q5FWH3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grhl3Q5FWH3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grhl3Q5FWH3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grhl3Q5FWH3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grhl3Q5FWH3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grhl3Q5FWH3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grhl3Q5FWH3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 693.5 ms