Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfmbt2Q5DTW2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms