Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm14685Q52KH6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm14685Q52KH6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm14685Q52KH6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm14685Q52KH6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms