Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBE8

Wdr18, WD repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr18Q4VBE8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Wdr18Q4VBE8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Wdr18Q4VBE8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Wdr18Q4VBE8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Wdr18Q4VBE8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Wdr18Q4VBE8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Wdr18Q4VBE8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Wdr18Q4VBE8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Wdr18Q4VBE8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Wdr18Q4VBE8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Wdr18Q4VBE8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wdr18Q4VBE8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Wdr18Q4VBE8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Wdr18Q4VBE8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Wdr18Q4VBE8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Wdr18Q4VBE8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Wdr18Q4VBE8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Wdr18Q4VBE8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Wdr18Q4VBE8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Wdr18Q4VBE8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wdr18Q4VBE8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Wdr18Q4VBE8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr18Q4VBE8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr18Q4VBE8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr18Q4VBE8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr18Q4VBE8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr18Q4VBE8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr18Q4VBE8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr18Q4VBE8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr18Q4VBE8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr18Q4VBE8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr18Q4VBE8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr18Q4VBE8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr18Q4VBE8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr18Q4VBE8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr18Q4VBE8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr18Q4VBE8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 888.2 ms