Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G9

1810049J17Rik, RIKEN cDNA 1810049J17 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810049J17RikQ3V2G9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810049J17RikQ3V2G9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1810049J17RikQ3V2G9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
1810049J17RikQ3V2G9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms