Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ckap2Q3V1H1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ckap2Q3V1H1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ckap2Q3V1H1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ckap2Q3V1H1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms