Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SvipQ3UZP4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SvipQ3UZP4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SvipQ3UZP4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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