Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc55Q3UY51 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lrrc55Q3UY51 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrc55Q3UY51 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc55Q3UY51 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms