Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd3l2Q3UXB0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd3l2Q3UXB0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms