Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm27235Q3UW50 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm27235Q3UW50 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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