Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP23

Tmem26, Transmembrane protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem26Q3UP23 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem26Q3UP23 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem26Q3UP23 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem26Q3UP23 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms