Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skap2Q3UND0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skap2Q3UND0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skap2Q3UND0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skap2Q3UND0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms