Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CrxosQ3UL53 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms