Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q3UJP5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q3UJP5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q3UJP5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q3UJP5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q3UJP5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q3UJP5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Q3UJP5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q3UJP5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Q3UJP5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Q3UJP5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3UJP5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3UJP5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3UJP5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3UJP5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3UJP5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3UJP5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3UJP5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3UJP5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms