Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sf3b2Q3UJB0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sf3b2Q3UJB0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sf3b2Q3UJB0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sf3b2Q3UJB0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sf3b2Q3UJB0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sf3b2Q3UJB0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sf3b2Q3UJB0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Sf3b2Q3UJB0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sf3b2Q3UJB0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sf3b2Q3UJB0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sf3b2Q3UJB0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sf3b2Q3UJB0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sf3b2Q3UJB0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sf3b2Q3UJB0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sf3b2Q3UJB0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sf3b2Q3UJB0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sf3b2Q3UJB0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sf3b2Q3UJB0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms