Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW5

Rnf10, RING finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf10Q3UIW5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf10Q3UIW5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf10Q3UIW5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf10Q3UIW5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf10Q3UIW5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf10Q3UIW5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf10Q3UIW5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf10Q3UIW5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf10Q3UIW5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf10Q3UIW5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf10Q3UIW5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf10Q3UIW5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf10Q3UIW5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf10Q3UIW5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf10Q3UIW5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf10Q3UIW5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf10Q3UIW5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms