Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Greb1Q3UHK3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Greb1Q3UHK3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Greb1Q3UHK3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Greb1Q3UHK3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Greb1Q3UHK3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Greb1Q3UHK3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Greb1Q3UHK3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Greb1Q3UHK3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Greb1Q3UHK3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Greb1Q3UHK3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Greb1Q3UHK3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Greb1Q3UHK3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Greb1Q3UHK3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Greb1Q3UHK3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Greb1Q3UHK3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Greb1Q3UHK3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Greb1Q3UHK3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms