Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mcrip1Q3UGS4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mcrip1Q3UGS4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mcrip1Q3UGS4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mcrip1Q3UGS4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mcrip1Q3UGS4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mcrip1Q3UGS4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mcrip1Q3UGS4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mcrip1Q3UGS4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mcrip1Q3UGS4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mcrip1Q3UGS4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms