Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc10a4Q3UEZ8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc10a4Q3UEZ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc10a4Q3UEZ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc10a4Q3UEZ8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms