Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Yipf3Q3UDR8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Yipf3Q3UDR8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Yipf3Q3UDR8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms