Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gse1Q3U3C9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gse1Q3U3C9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gse1Q3U3C9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms