Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Vars2Q3U2A8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vars2Q3U2A8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vars2Q3U2A8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vars2Q3U2A8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vars2Q3U2A8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vars2Q3U2A8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vars2Q3U2A8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vars2Q3U2A8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vars2Q3U2A8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vars2Q3U2A8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vars2Q3U2A8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vars2Q3U2A8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vars2Q3U2A8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vars2Q3U2A8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vars2Q3U2A8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vars2Q3U2A8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vars2Q3U2A8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vars2Q3U2A8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vars2Q3U2A8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Vars2Q3U2A8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms