Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1T9

Dennd1b, DENN domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dennd1bQ3U1T9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Dennd1bQ3U1T9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dennd1bQ3U1T9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dennd1bQ3U1T9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms