Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc174Q3U155 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc174Q3U155 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc174Q3U155 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms