Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf6Q3TWW8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf6Q3TWW8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf6Q3TWW8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf6Q3TWW8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf6Q3TWW8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srsf6Q3TWW8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srsf6Q3TWW8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srsf6Q3TWW8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srsf6Q3TWW8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srsf6Q3TWW8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf6Q3TWW8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms