Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccndbp1Q3TVC7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccndbp1Q3TVC7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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