Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CiartQ3TQ03 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CiartQ3TQ03 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CiartQ3TQ03 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms