Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
H2afvQ3THW5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
H2afvQ3THW5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms