Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9I3

Gm1968, Predicted gene 1968, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1968Q3T9I3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1968Q3T9I3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm1968Q3T9I3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm1968Q3T9I3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm1968Q3T9I3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm1968Q3T9I3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm1968Q3T9I3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1968Q3T9I3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1968Q3T9I3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1968Q3T9I3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1968Q3T9I3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1968Q3T9I3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm1968Q3T9I3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm1968Q3T9I3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm1968Q3T9I3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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