Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chrna5Q2MKA5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chrna5Q2MKA5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chrna5Q2MKA5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chrna5Q2MKA5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chrna5Q2MKA5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Chrna5Q2MKA5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chrna5Q2MKA5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrna5Q2MKA5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms