Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd3Q14AI6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd3Q14AI6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms