Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Traf3ip1Q149C2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Traf3ip1Q149C2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Traf3ip1Q149C2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Traf3ip1Q149C2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms