Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Gli2Q0VGT2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Gli2Q0VGT2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Gli2Q0VGT2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Gli2Q0VGT2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Gli2Q0VGT2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Gli2Q0VGT2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Gli2Q0VGT2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms